すぐsprintf関数をつかうのは、きっとbad practiceです。

1 小数点以下の表示桁数

デフォルトの小数点以下の桁数は6です¹。

pi

[1] 3.14159

options(digits=n)（n∈ℕ）で変更できます。

options(digits=3)
pi

[1] 3.14

options(digits=10)
pi

[1] 3.141592654

1.1 `format(x, digits=n)`でも指定できる

グローバルな設定に左右されたくない関数内などでは、optionsを変えるよりはformat関数を使う方がよいでしょう。

options(digits=1)
format(pi, digits=10)

[1] "3.141592654"

デフォルトでは1e+5以上は指数表記になります²。

10^5-1

[1] 99999

10^5

[1] 1e+05

options(digits=n)（n∈ℕ）で1e+5の+5のところを増減できます。

まずは増やしてみましょう。

options(scipen=1)
10^5-1

[1] 99999

10^5

[1] 100000

10^6-1

[1] 999999

10^6

[1] 1e+06

次は減らしてみましょう。

options(scipen=-2)
10^5-1

[1] 1e+05

10^5

[1] 1e+05

10^3-1

[1] 999

10^3

[1] 1e+03

ドキュメントの英語が分かりづらいと言う話を見かけたのですが、そもそも相対指定なのが分かりづらいですね。

グローバルな設定に左右されたくない関数内などでは、optionsを変えるよりはformat関数を使う方がよいでしょう。

options(scipen=-3)
format(10^5, digits=10)

[1] "1e+05"

.Rprofileに命令を書いておくと、起動時に自動的に設定されます。

MS-Windowsでファイルパスが分からないとき³、テキストエディタのファイル名制限でこの名前のファイルが作れないときは⁴、

cat("options(digits=8);options(scipen=3)",
    file = file.path(Sys.getenv("R_USER"), ".Rprofile"),
    append = TRUE)

とRのコンソールに打ち込めば、作成もしくは追記ができます。